Le conflit armé entre Boko Haram et les forces gouvernementales nigérianes a commencé en 2009, dans le nord-est du pays (États du Borno, Adamawa,Yobe, Gombe, Taraba, Bauchi) avant de s’étendre à la région du Lac Tchad et aux territoires limitrophes. Depuis 2015, la Force Multinationale mixte unissant des troupes du Tchad, du Nigeria, du Cameroun, du Niger et du Bénin a réussi à reprendre de nombreux bastions de Boko Haram. Mais le groupe continue de mener des attaques-suicides contre les civils.

Les violations du droit international humanitaire et des droits de l’homme, l’insécurité et la peur ont provoqué une crise humanitaire majeure. Le Nigeria compte 1,7 millions de déplacés (dont 52 % de femmes et 65 % d’enfants) et les ressources des communautés d’accueil sont soumises à rude épreuve. Ainsi les cas de malnutrition se multiplient dans le nord-est du pays et quelque 400 000 personnes sont frappées par la famine. Les populations souffrent également du manque d’accès à l’eau potable, de mauvaises conditions d’hygiène et d’assainissement et sont exposées aux épidémies comme le choléra. Dans un tel contexte, l’accès aux soins reste très délicat. Sur les 755 centres de santé de l’État du Borno, 39 % sont inutilisables et 27 % sont partiellement endommagées. La crise humanitaire engendrée par ce conflit ne touche pas seulement la santé physique des populations au Nigeria. Le conflit impacte également fortement le bien être psychologique des populations. On estime que plus de 12 % d’entre-elles souffriront d'une forme de maladie mentale au cours de leur vie.